承担海洋生态环境监管工作，拟订并组织实施重点海域生态环境规划和近岸海域功能区划，监督协调重点海域生态环境综合治理工作。监督陆源污染物排海，承担防治海岸和海洋工程建设项目、废弃物海洋倾倒等对海洋污染损害的生态环境保护工作。